(57) Изобретение относится к области биотехнологии и молекулярной генетики и может быть использовано в медицинской микробиологии, эпидемиологии, клинической лабораторной диагностике для диагностики инвазивного кандидоза. Способ диагностики инвазивного кандидоза и видовой идентификации его основных возбудителей методом ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме реального времени включает две мультиплексные реакции на базе уникального набора праймеров и зондов. Технический результат состоит в обеспечении возможности точной диагностики инвазивного кандидоза и видовой идентификации его основных возбудителей методом ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме реального времени.