(57) Изобретение относится к промышленным способам очистки композиций ботулинического токсина, полученных из культур клеток. Способы очистки по настоящему изобретению основаны на серии стадий фильтрации и хроматографического разделения, которые дают высокочистую композицию ботулинического токсина, которая содержит белковые молекулы ботулинического токсина (приблизительно 150 кДа) в растворе, который не содержит, по существу не содержит или практически не содержит, ботулинических токсиновых комплексов и продуктов животного происхождения, и не включают осаждение или лиофилизацию белковых молекул ботулинического токсина. В способе очистки по настоящему изобретению не использованы стадии осаждения, лиофилизации или центрифугирования, и он обеспечивает получение высокочистых, высокоактивных, свободных белковых молекул ботулинического токсина (приблизительно 150 кДа) в растворе без необходимости восстановления конечным пользователем.