(57) 1. Способ определения изменений фекальной микробиоты индивида после приема пробиотической/парабиотической композиции согласно рандомизированному, двойному слепому, плацебо-контролируемому перекрестному протоколу, включающий следующие стадии:
1) собирают информацию о состоянии здоровья и/или особенностях питания указанного индивида до, во время и после приема композиции или плацебо согласно указанному протоколу;
2) получают по меньшей мере первый образец кала от указанного индивида;
3) вводят указанному индивиду а) композицию, содержащую микроорганизмы, или б) плацебо, не содержащее микроорганизмов;
4) получают по меньшей мере второй образец кала от указанного индивида после введения композиции или плацебо;
5) осуществляют фазу выведения, на которой указанному индивиду не вводят ни композицию, содержащую микроорганизмы, ни плацебо;
6) получают по меньшей мере третий образец кала от указанного индивида после фазы выведения;
7) вводят указанному индивиду а) композицию, содержащую микроорганизмы, или б) плацебо;
8) получают по меньшей мере четвертый образец кала от указанного индивида после введения композиции или плацебо;
9) анализируют микробиоту посредством проведения метагеномного анализа образцов кала; и
10) сравнивают качественно и/или количественно фекальную микробиоту индивида до, во время и после приема композиции или плацебо согласно указанному протоколу.
2. Способ по п.1, где указанные микроорганизмы представляют собой бактерии и/или дрожжи, взятые по отдельности или в комбинации.
3. Способ по п.1 или 2, где указанные микроорганизмы принадлежат к роду, выбранному из Lactobacillus, Bifidobacterium, Bacillus, Propionibacterium, Streptococcus, Lactococcus, Aerococcus и Enterococcus; предпочтительно указанный микроорганизм представляет собой бактерию рода Lactobacillus и/или Bifidobacterium.
4. Способ по любому из пп.1-3, где указанные микроорганизмы представляют собой бактерии рода Lactobacillus, выбранные из следующих видов: Lactobacillus paracasei, предпочтительно штамм Lactobacillus paracasei DG, Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus amylolyticus, Lactobacillus amylovorus, Lactobacillus alimentarius, Lactobacillus aviaries, Lactobacillus brevis, Lactobacillus buchneri, Lactobacillus casei, Lactobacillus cellobiosus, Lactobacillus coryniformis, Lactobacillus crispatus, Lactobacillus curvatus, Lactobacillus delbrueckii, Lactobacillus farciminis, Lactobacillus fermentum, Lactobacillus gallinarum, Lactobacillus gasseri, Lactobacillus helveticus, Lactobacillus hilgardii, Lactobacillus johnsonii, Lactobacillus kefiranofaciens, Lactobacillus kefiri, Lactobacillus mucosae, Lactobacillus panis, Lactobacillus collinoides, Lactobacillus paraplantarum, Lactobacillus pentosus, Lactobacillus plantarum, Lactobacillus pontis, Lactobacillus reuteri, Lactobacillus rhamnosus, Lactobacillus sakei, Lactobacillus salivarius и Lactobacillus sanfranciscensis.
5. Способ по любому из пп.1-4, где указанные микроорганизмы присутствуют в композиции в количестве от 1 до 50 миллиардов колониеобразующих единиц (КОЕ) микроорганизмов, предпочтительно 15-30, более предпочтительно от 20 до 25 миллиардов КОЕ микроорганизмов.
6. Способ по любому из пп.1-5, где указанные микроорганизмы присутствуют в композиции в форме живых или мертвых микроорганизмов или в форме лизата или экстракта.
7. Способ по любому из пп.1-6, где композиция, содержащая микроорганизмы, изготовлена для перорального введения предпочтительно в твердой форме, предпочтительно в форме пилюль, капсул, таблеток, гранулярного порошка, твердых капсул, водорастворимых гранул, саше или пеллет.
8. Способ по любому из пп.1-7, где метагеномный анализ включает по меньшей мере одну, предпочтительно все из следующих стадий:
выделение нуклеиновых кислот, предпочтительно ДНК, из образца кала; и
молекулярное типирование микроорганизмов, присутствующих в фекальной микробиоте.
9. Способ по п.8, где типирование фекальной микробиоты проводят посредством анализа нуклеотидной последовательности по меньшей мере части гена, кодирующего 16S субъединицу рибосомы.
10. Способ по п.8 или 9, где типирование фекальной микробиоты проводят посредством амплификации нуклеотидной последовательности по меньшей мере части гена, кодирующего 16S субъединицу рибосомы, с помощью ПЦР (полимеразная цепная реакция).
11. Способ по п.10, где ПЦР проводят с использованием SEQ ID NO: 1 и 2.
12. Способ по п.10 или 11, где амплифицированную нуклеотидную последовательность секвенируют предпочтительно с применением методики секвенирования Ion Torrent.
13. Способ по любому из пп.8-12, где характеристики микроорганизмов определяют с применением программ иерархической кластеризации и/или таксономического анализа и/или построением филогенетических дендрограмм предпочтительно с тепловыми картами.
14. Способ по п.13, где результаты определения характеристик анализируют с применением параметрических и/или непараметрических статистических методов.

---