(21)	201990916 (13) A1	Разделы: A B C E F G H
(22)	2017.07.11
(51)	C40B 50/02 (2006.01) G06F 19/26 (2011.01) G06F 19/22 (2011.01)
(31)	PCT/EP2016/074311; PCT/EP2016/074297; PCT/EP2016/074307; PCT/EP2016/074301; PCT/US2017/017841; PCT/US2017/017842
(32)	2016.10.11; 2016.10.11; 2016.10.11; 2016.10.11; 2017.02.14; 2017.02.14
(33)	EP; EP; EP; EP; US; US
(86)	PCT/US2017/041591
(87)	WO 2018/071080 2018.04.19
(88)	2018.06.28
(71)	ГЕНОМСИС СА (CH)
(72)	Альберти Клаудио, Зоя Джорджио, Рензи Даниэле (CH), Балуч Мохамед Хосо (US)
(74)	Рыбина Н.А., Рыбин В.Н. (RU)
(54)	СПОСОБЫ И СИСТЕМЫ ДЛЯ ПРЕДСТАВЛЕНИЯ И ОБРАБОТКИ БИОИНФОРМАЦИОННЫХ ДАННЫХ С ПРИМЕНЕНИЕМ РЕФЕРЕНСНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

(57) Способ и устройство для представления и обработки данных геномных последовательностей, полученных с помощью устройств секвенирования генома, при выравнивании относительно одной или более референсных последовательностей. Риды последовательностей кодируются посредством их выравнивания по отношению к уже существующим или сконструированным референсным последовательностям. После выравнивания процесс кодирования состоит из классификации ридов на классы данных с последующим кодированием каждого класса данных в терминах множества слоев дескрипторов. Для кодирования подгрупп дескрипторов, используемых для представления каждого класса данных, используются определенные исходные модели и энтропийные кодеры.