(57) Предложены способы обнаружения и/или различения вариантов посттрансляционной модификации представляющего интерес антитела в образце. Указанные способы включают приведение образца, содержащего одно или более представляющих интерес антител, в контакт с протеазой для расщепления образца на фрагменты антител; разделение фрагментов антител по молекулярной массе и/или заряду в одном или более капиллярах с применением капиллярного электрофореза; элюирование разделенных фрагментов антител из одного или более капилляров; и определение массы элюированных фрагментов антитела с помощью масс-спектрометрии, тем самым обнаруживая и/или различая варианты посттрансляционной модификации представляющего интерес антитела.