(57) Изобретение относится к способу идентификации и количественной оценки полипептида из библиотеки полипептидов. Способ включает стадии: 1 - получения библиотеки полипептидов и библиотеки меток для детекции, 2 - получения гнездовой библиотеки, содержащей полипептиды и метки для детекции, 3 - секвенирования гнездовой библиотеки, 4 - отбора члена гнездовой библиотеки на одной или более стадиях отбора, которые являются независимыми от физической связи генотип-фенотип, 5 - выделения метки для детекции из отобранного полипептида, 6 - идентификации и количественной оценки метки для детекции посредством масс-спектрометрии, 7 - получения последовательности отобранного полипептида. Изобретение также относится к коллекции полипептидов, к коллекции меток для детекции и к коллекции плазмидных векторов.