(57) 1. Полипептид, который
(i) содержит аминокислотную последовательность,
представленную в SEQ ID NO:2; SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6,
SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:14,
SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:22,
SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:26, SEQ ID NO:28 и/или SEQ ID NO:30; или
(ii) представляет собой функциональный эквивалент (i).
2. Полипептид по п.1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:24 и/или SEQ ID NO:30.
3. Полипептид по п.1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:26 и/или SEQ ID NO:28, или состоит из указанной последовательности.
4. Полипептид по п.1 или 2, который состоит из аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO:2; SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:26, SEQ ID NO:28 и/или SEQ ID NO:30.
5. Полипептид, который является функциональным эквивалентом в соответствии с подпунктом (ii) по любому из предшествующих пунктов и отличается тем, что гомологичен аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:16 или SEQ ID NO:18, и является членом семейства гликопротеинов клеточной поверхности.
6. Полипептид, который является функциональным эквивалентом по любому из пп.1-3 и который более чем на 80%, предпочтительно более чем на 85, 90, 95, 98 или 99%, идентичен аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:16 или SEQ ID NO:18, или ее активному фрагменту.
7. Полипептид, который является функциональным эквивалентом по любому из пп.1-6 и который обладает значительной структурной гомологией с полипептидом, имеющим аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:16 или SEQ ID NO:18.
8. Очищенная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид по любому из предшествующих пунктов.
9. Очищенная молекула нуклеиновой кислоты по п.8, которая содержит последовательность, представленную в SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:27 и/или SEQ ID NO:29, или представляет собой ее избыточный эквивалент или фрагмент.
10. Очищенная молекула нуклеиновой кислоты по п.9, которая состоит из последовательности нуклеиновой кислоты, представленной в SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:13 или SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:27 и/или SEQ ID NO:29, или представляет собой ее избыточный эквивалент или фрагмент.
11. Очищенная молекула нуклеиновой кислоты, которая гибридизуется с молекулой нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-10 в условиях высокой жесткости.
12. Вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11.
13. Клетка-хозяин, трансформированная вектором по п.12.
14. Лиганд, который специфически связывается с гликопротеином клеточной поверхности по любому из пп.1-7.
15. Лиганд по п.14, который представляет собой антитело.
16. Соединение, которое связывается с полипептидом по любому из пп.1-7, не индуцируя при этом каких-либо биологических эффектов указанного полипептида.
17. Соединение по п.16, которое представляет собой природный или модифицированный субстрат, лиганд, фермент, рецептор либо структурный или функциональный миметик.
18. Гибридный полипептид, содержащий полипептид по любому из пп.1-7, слитый с гетерологичной аминокислотной последовательностью.
19. Гибридный полипептид по п.18, где указанной гетерологичной аминокислотной последовательностью является константный домен IgG или его фрагмент или домен hCG или его фрагмент.
20. Применение полипептида по любому из пп.1-7, молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11, вектора по п.12, лиганда по п.14 или 15, соединения по любому из п.16 или 17 или гибридного полипептида по п.18 или 19 в терапии или диагностике заболевания.
21. Способ диагностики заболевания у пациента, включающий оценку уровня экспрессии природного гена, кодирующего полипептид по любому из пп.1-7, или оценку активности полипептида по любому из пп.1-7 в ткани указанного пациента, и сравнение указанного уровня экспрессии или активности с контрольным уровнем, где уровень, отличающийся от указанного контрольного уровня, является признаком наличия заболевания.
22. Способ по п.21, осуществляемый in vitro.
23. Способ по п.21 или 22, который включает стадии (а) контактирования лиганда по п.14 или 15 с биологическим образцом в условиях, подходящих для образования комплекса лиганд-полипептид; и (b) детектирования указанного комплекса.
24. Способ по п.21 или 22, включающий стадии
a) контактирования образца ткани, взятой у пациента, с нуклеиновокислотным зондом в жестких условиях, способствующих образованию гибридного комплекса между молекулой нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11 и указанным зондом;
b) контактирования контрольного образца с указанным зондом в условиях, аналогичных условиям стадии (а); и
c) детектирования присутствия гибридных комплексов в указанных образах, где детектирование уровней указанного гибридного комплекса в образце, взятом у данного пациента, которые отличаются от уровней гибридного комплекса в контрольном образце, указывает на наличие заболевания.
25. Способ по п.21 или 22, включающий в себя
a) контактирование образца нуклеиновой кислоты ткани, взятой у пациента, с нуклеиновокислотным праймером в жестких условиях, способствующих образованию гибридного комплекса между молекулой нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11 и указанным праймером;
b) контактирование контрольного образца с указанным праймером в условиях, аналогичных условиям стадии (а);
c) амплификацию указанного образца нуклеиновой кислоты и
d) детектирование уровня амплифицированной нуклеиновой кислоты в образцах, взятых у пациента, и в контрольных образцах, где детектирование уровней амплифицированной нуклеиновой кислоты во взятом у пациента образце, которые значительно отличаются от уровней амплифицированной нуклеиновой кислоты в контрольном образце, указывает на наличие заболевания.
26. Способ по п.21 или 22, включающий
a) получение образца тканей от пациента, обследуемого на наличие заболевания;
b) выделение молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11 из указанного образца ткани и
c) установление диагноза заболевания данного пациента путем детектирования присутствия мутации в молекуле нуклеиновой кислоты, где указанная мутация ассоциирована с указанным заболеванием и где присутствие такой мутации указывает на наличие заболевания.
27. Способ по п.26, который дополнительно включает в себя амплификацию указанной молекулы нуклеиновой кислоты с образованием амплифицированного продукта и детектирование присутствия или отсутствия мутации в указанном амплифицированном продукте.
28. Способ по пп.26 или 27, где присутствие или отсутствие мутации у пациента определяют путем осуществления контакта указанной молекулы нуклеиновой кислоты с нуклеиновокислотным зондом, который гибридизуется с указанной молекулой нуклеиновой кислоты в жестких условиях, с образованием гибридной двухцепочечной молекулы, где указанная гибридная двухцепочечная молекула имеет негибридизованную часть цепи нуклеиновокислотного зонда в любой области, соответствующей мутации, ассоциированной с заболеванием; и детектирования присутствия или отсутствия негибридизованной части цепи указанного зонда как показателя присутствия или отсутствия ассоциированной с заболеванием мутации.
29. Способ по любому из пп.21-28, где указанными заболеваниями являются, но не ограничиваются ими, воспаление, рак, рак толстой кишки, воспалительное заболевание кишечника, расстройство поджелудочной железы и/или IL-2-ассоциированное заболевание.
30. Способ по любому из пп.21-28, где указанным заболеванием является заболевание, в патогенезе которого участвует лимфоцитарные антигены.
31. Применение полипептида по любому из пп.1-7 в качестве гликопротеина клеточной поверхности.
32. Фармацевтическая композиция, содержащая полипептид по любому из пп.1-7.
33. Фармацевтическая композиция, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11.
34. Фармацевтическая композиция, содержащая вектор по п.12.
35. Фармацевтическая композиция, содержащая клетку-хозяина по п.13.
36. Фармацевтическая композиция, содержащая лиганд по п.14 или 15.
37. Фармацевтическая композиция, содержащая соединение по любому из п.16 или 17.
38. Фармацевтическая композиция, содержащая гибридный полипептид по п.18 или 19.
39. Вакцинная композиция, содержащая полипептид по любому из пп.1-7 или молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11.
40. Применение полипептида по любому из пп.1-7, молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11, вектора по п.12, клетки-хозяина по п.13, лиганда по п.14 или 15, соединения по любому из п.16 или 17, гибридного полипептида по п.18 или 19 или фармацевтической композиции по любому из пп.32-38 для получения лекарственного средства для лечения воспаления, рака, воспалительного заболевания кишечника, расстройства поджелудочной железы и/или IL-2-ассоциированного заболевания.
41. Применение полипептида по любому из пп.1-7, молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11, вектора по п.12, клетки-хозяина по п.13, лиганда по п.14 или 15, соединения по любому из п.16 или 17, гибридного полипептида по п.18 или 19 или фармацевтической композиции по любому из пп.32-38 для получения лекарственного средства для лечения заболевания, в патогенезе которого участвуют лимфоцитарные антигены.
42. Способ лечения заболевания у пациента, включающий в себя введение указанному пациенту полипептида по любому из пп.1-7, молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11, вектора по п.12, клетки-хозяина по п.13, лиганда по п.14 или 15, соединения по любому из п.16 или 17, гибридного полипептида по п.18 или 19 или фармацевтической композиции любому из пп.32-38.
43. Способ по п.42, где для лечения заболеваний, при которых уровень экспрессии природного гена или активности указанного полипептида у пациента, страдающего заболеванием, ниже, чем уровень экспрессии или активности у здорового пациента, данному пациенту вводят полипептид, молекулу нуклеиновой кислоты, вектор, лиганд, соединение или композицию, которые являются агонистами.
44. Способ по п.42, где для лечения заболеваний, при которых уровень экспрессии природного гена или активности указанного полипептида у пациента, страдающего заболеванием, выше, чем уровень экспрессии или активности у здорового пациента, данному пациенту вводят полипептид, молекулу нуклеиновой кислоты, вектор, лиганд, соединение или композицию, которые являются антагонистами.
45. Способ мониторинга терапевтического лечения заболевания у пациента, включающий в себя мониторинг уровня экспрессии или активности полипептида по любому из пп.1-7 или уровня экспрессии молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11 в ткани указанного пациента, проводимый в течение определенного периода времени, где изменение указанного уровня экспрессии или активности за определенный промежуток времени по сравнению с контрольным уровнем является показателем рецидива указанного заболевания.
46. Способ идентификации соединения, которое является эффективным для лечения и/или диагностики заболевания, включающий в себя контактирование полипептида по любому из пп.1-7 с одним или несколькими соединениями, предположительно обладающими аффинностью связывания с указанным полипептидом или молекулой нуклеиновой кислоты; и отбор соединения, которое специфически связывается с указанной молекулой нуклеиновой кислоты или полипептидом.
47. Способ идентификации соединения, которое является эффективным для лечения и/или диагностики заболевания, включающий в себя контактирование молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11 с одним или несколькими соединениями, предположительно обладающими аффинностью связывания с указанным полипептидом или молекулой нуклеиновой кислоты; и отбор соединения, которое специфически связывается с указанной молекулой нуклеиновой кислоты или полипептидом.
48. Набор, используемый для диагностики заболевания и включающий в себя первый контейнер, содержащий нуклеиновокислотный зонд, который гибридизуется в жестких условиях с молекулой нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11; второй контейнер, содержащий праймеры, подходящие для амплификации указанной молекулы нуклеиновой кислоты; и инструкции по использованию зонда и праймеров для облегчения диагностики заболевания.
49. Набор по п.45, дополнительно включающий в себя третий контейнер, содержащий агент для гидролиза негибридизованной РНК.
50. Набор, содержащий массив молекул нуклеиновой кислоты, по меньшей мере одной из которых является молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11.
51. Набор, содержащий одно или несколько антител, связывающихся с полипептидом по любому из пп.1-7, и реагент, используемый для детектирования реакции связывания между указанным антителом и указанным полипептидом.
52. Трансгенное или дефицитное по данному полипептиду животное, не являющееся человеком, которое было трансформировано так, что оно экспрессирует более высокие или более низкие уровни полипептида по любому из пп.1-7 или вообще не экспрессирует указанного полипептида.
53. Способ скрининга на соединение, эффективное для лечения заболевания, включающий в себя контактирование трансгенного животного, не являющегося человеком, по п.52 с соединением-кандидатом и оценку эффективности указанного соединения для лечения такого заболевания у указанного животного.
54. Применение полипептида по любому из пп.1-7, молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11, вектора по п.12, клетки-хозяина по п.13, лиганда по п.14 или 15, соединения по любому из п.16 или 17, гибридного полипептида по п.18 или 19 или фармацевтической композиции по любому из пп.32-38 для оплодотворения в пробирке (IVF) или в качестве контрацептива.
55. Применение полипептида по любому из пп.1-7, молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.8-11, вектора по п.12, клетки-хозяина по п.13, лиганда по п.14 или 15, соединения по любому из п.16 или 17, гибридного полипептида по п.18 или 19 или фармацевтической композиции по любому из пп.32-38 для изготовления контрацептива.
56. Применение полипептида INSP201 в качестве мишени для поиска лекарственных средств-кандидатов, которые могут быть использованы для лечения или предупреждения расстройства, ассоциированного с гликопротеином клеточной поверхности.
57. Способ отбора биологически активных соединений, включающий в себя
(i) контактирование соединения-кандидата с рекомбинантными клетками-хозяевами, экспрессирующими полипептид INSP201;
(ii) отбор соединений, которые связываются с указанным полипептидом INSP201 на поверхности указанных клеток и/или модулируют активность указанного полипептида INSP201.
|
